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RM 8393人類DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)(中國(guó)血統(tǒng))的操作注意

發(fā)布時(shí)間: 2023-10-07  點(diǎn)擊次數(shù): 541次

RM 8393人類DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)(中國(guó)血統(tǒng))的操作注意

       本標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)(RM)用于驗(yàn)證、優(yōu)化和工藝評(píng)估。它由來自個(gè)人基因組計(jì)劃(ID hu91BD69)的東亞(中國(guó))血統(tǒng)的男性基因組樣本組成,可用于評(píng)估基因組測(cè)序中變異調(diào)用的性能。RM 8393的單元由含有從來自Coriell醫(yī)學(xué)研究所(新澤西州卡姆登)的單個(gè)大生長(zhǎng)的人類淋巴母細(xì)胞系GM24631(標(biāo)記為HG-005)中提取的人類基因組DNA的小瓶組成。小瓶含有約10µg的基因組DNA,DNA在TE緩沖液中(10mM TRIS,1mM EDTA,pH 8.0)。

品牌:NIST標(biāo)準(zhǔn)品

RM Number(貨號(hào)):RM 8393

DescriptionHuman DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Son of Chinese Ancestry) (HG-005)

描述:人類DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)(中國(guó)血統(tǒng))

Unit of Issue(產(chǎn)品規(guī)格):1 vial

NIST另有10支裝可選

8393-01-500.jpg

RM 8393人類DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)(中國(guó)血統(tǒng))的操作注意

       儲(chǔ)存:RM 8393儲(chǔ)存在NIST的–20°C溫度下,但將與冷凍包一起裝運(yùn),可能不會(huì)冷凍到達(dá)。收到后,RM 8393應(yīng)在–20°C的黑暗中長(zhǎng)期儲(chǔ)存,或在4°C的暗處短期儲(chǔ)存(如果即將使用)。

       使用:建議將vcf與基準(zhǔn)vcf進(jìn)行比較后,只有基準(zhǔn)區(qū)域內(nèi)的變體才會(huì)被視為真陽(yáng)性、假陽(yáng)性和假陰性。此外,為了了解假陽(yáng)性和假陰性的原因,包括基準(zhǔn)集中錯(cuò)誤的可能性,強(qiáng)烈建議用戶使用基因組瀏覽器手動(dòng)檢查假定假陽(yáng)性和偽陰性子集周圍的對(duì)齊讀數(shù)。為了開發(fā)性能指標(biāo)的標(biāo)準(zhǔn)化定義和工具,以比較具有不同表示的變體調(diào)用,全球基因組學(xué)和健康基準(zhǔn)團(tuán)隊(duì)聯(lián)盟發(fā)布了在人類基因組中基準(zhǔn)種系小變體調(diào)用的實(shí)踐,我們強(qiáng)烈建議如下。隨著測(cè)序技術(shù)和分析方法的改進(jìn),這些基準(zhǔn)調(diào)用和區(qū)域?qū)⒂貌煌夸浿形募木?xì)版本進(jìn)行更新,本調(diào)查報(bào)告將定期更新,以反映重要的新版本。當(dāng)前版本包含來自基因組參考聯(lián)盟的GRCh37和GRCh38參考組件的小變體基準(zhǔn)集。參考文獻(xiàn)4中描述了該基因組的各種技術(shù)的數(shù)據(jù)集。


部分NIST標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)產(chǎn)品目錄(僅列舉小部分):

RM 8376用于檢測(cè)和鑒定的微生物病原體 DNA 標(biāo)準(zhǔn)品20 tubes
SRM 2383a嬰兒食品復(fù)合材料4 x 70 g
SRM 1958強(qiáng)化人血清中的有機(jī)污染物5 vials x 10.7 mL
SRM 909c冷凍人血清3 vials x 2 mL
SRM 3186磷酸根陰離子 (PO43-) 標(biāo)準(zhǔn)溶液5 x 10 mL
SRM 2775鑄造用焦炭中的硫50 g
SRM 2385菠菜泥4 x 70 g
SRM 1223鉻鋼disk
SRM 1082香煙點(diǎn)火強(qiáng)度標(biāo)準(zhǔn)1 carton (200 cigarettes)
SRM 2556用過的汽車催化劑(顆粒)70 g
SRM 628鋅基壓鑄合金 D(塊狀)block
SRM 125bLA鋼,高硅100 g
SRM 762磁矩標(biāo)準(zhǔn) - 鎳盤6 mm dia


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